角膜软化症的治疗原则就是及时补充维生素A，并配合相关症状的对症治疗，防止严重的并发症。
一、药物治疗
1、维生素A：此病因缺乏维生素A引起，应肌肉注射维生素A、服用如鱼肝油，因鱼肝油内主要含有维生素A和维生素D等物质。
2、利福平：利福平是一种脂溶性的抗生素，容易穿透细胞膜，进入细胞内杀死细菌。利福平眼药水通常用于一些眼部的疾病，包括沙眼、结膜炎、角膜炎等眼科疾患，眼部给药吸收后可弥散至大部分体液和组织中，因而可使体液呈橘红色或红棕色。对利福平过敏、严重肝功能不全以及胆道阻塞患者禁用，5岁以下小儿应慎用。
3、玻璃酸钠：泪液分为三部分，有脂质层、水液层和粘蛋白层，而玻璃酸钠往往就能够补充泪液的水液层，让眼泪保持一种非常丰盈的状态，让眼睛避免干涩和疲劳。
4、1%阿托品：阿托品阻断M胆碱受体，使瞳孔括约肌和睫状肌松弛，导致去甲肾上腺素能神经支配的瞳孔扩大肌的功能占优势，从而使瞳孔散大。瞳孔散大把虹膜推向虹膜角膜角，妨碍房水通过小梁网排入巩膜静脉窦，引起眼压升高。用于此病炎症反应时及前房积脓时，防止虹膜粘连。
二、手术治疗
1、角膜移植术：角膜移植手术是用透明的角膜片置换混浊或有病变部分的角膜，以达到增视、治疗某些角膜病和改善外观的目的，是异体移植效果最好的一种手术。
2、羊膜遮盖：羊膜覆盖为眼科手术，用羊膜修复眼结膜、角膜缺损区的创面，可提供一个理想的基底膜，使其迅速上皮化生及创口愈合。
三、其他治疗
角膜绷带镜：角膜绷带镜也叫做角膜接触镜，是一种戴在眼球角膜上用来治疗的镜片。目前，角膜绷带镜已经在眼科临床上广泛应用，治疗各种眼表疾病以及相关手术后的辅助治疗等等。因为角膜绷带镜能够帮助患者迅速修复角膜上皮，缩短角膜上皮修复的时间，而且能使角膜上皮的形成更加光滑。