导致孕酮下降的原因有多方面，主要表现为以下几方面：一、母体自身激素不够，胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，雌激素、孕激素、绒毛膜促性腺激素。如果母体自身的内源性激素不够，就会导致孕酮下降，造成胚胎停育。二、疾病因素：先兆流产、宫外孕、早产、闭经、不孕症等，都可以直接引起孕酮下降。三、黄体功能不全，如果黄体功能不完整，卵巢黄体发育不全时，孕酮含量会相应的下降。四、肾上腺、甲状腺功能严重失调，也会影响卵巢功能，导致怀孕受到阻碍和影响，使排卵发生障碍，孕酮含量也会相应的下降。