甲状腺的疾病主要跟甲状腺激素水平高低有一定关系，同时跟甲状腺本身是否出现了团块，以及结节是否发生了癌变有一定关系。甲状腺激素水平发生异常，最常见的甲状腺疾病是弥漫性甲状腺肿，伴甲状腺功能亢进症以及急性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎、桥本氏甲状腺炎。
发生甲状腺疾病时出现各自临床症状，发生甲亢时给予抗甲状腺激素的药物治疗，发生甲状腺功能减退症时给予左甲状腺激素替代治疗。发生甲状腺癌症病变时，应该给予手术或者核素碘-131的治疗，具体根据患者发生的临床症状、体征、实验室检查综合评判，然后再给予对症的治疗。