肛肠科的检查首先选用肛门指诊的方法，先检查肛门缘周围的皮肤是不是有红肿、压痛和硬块，如果有常，提示为肛周脓肿。其次，看前、后正中位是不是有触痛，如果有，提示为肛裂，可进一步扒开肛门看是不是有裂创。肛门外缘如果有外溃口，并且伴有皮下有条索状通向肛内，常提示为肛瘘。肛门周围检查完毕之后，将右手食指涂上肥皂液、液体石蜡或者凡士林，用右手食指轻轻按摩肛缘同时嘱病人做深呼吸，以减轻腹压、使括约肌松弛，将食指伸入患者肛门。若突然将手指插入肛门括约肌，会导致突然受刺激而产生痉挛，不仅不易插入，而且还会产生疼痛。