肠道病毒性感染目前没有特效药物，大多数肠道病毒感染性疾病有一定的自限性，一般一周左右大部分可以痊愈，所以病毒性肠炎的治疗主要还是对症治疗，预防并发症的发生。常用药物有：口服补液盐、中药制剂、肠道益生菌调节剂、补液、肠道粘膜保护剂、预防性使用抗生素等。益生菌有：妈咪爱、思连康、培菲康、整肠生等；中药制剂有：黄根黄连汤或者中药汤药加减之类。