甲状腺常见的炎症有急性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎、桥本氏甲状腺炎，临床上常见的是亚急性甲状腺炎和桥本氏甲状腺炎。
发生亚急性甲状腺炎时都是给予对症处理，给予退烧药、止疼药，只有极少数患者可发生永久性甲减，需要给予左甲状腺激素替代治疗，症状严重的患者可给予糖皮质激素进行治疗。亚急性甲状腺炎是由病毒感染所导致的甲状腺疾病，患者可出现上呼吸道感染的症状，2-3周以后甲状腺出现结节、疼痛、触痛明显。早期由于甲状腺激素释放入血，患者可产生一过性甲亢，随之出现一过性甲减，然后到达恢复期，由于是病毒感染，基本多呈自限性，整个病史大约2-3个月。
桥本氏甲状腺炎属于自身免疫性疾病，患者最终发生甲状腺功能减退症。在没有发生甲减时，暂时不需要特殊的治疗，只是定期复查，发生甲减时给予左甲状腺激素替代治疗。