1、血常规：所有的血液成分均可能减少，外周血白细胞计数可降到(1～4)×10^9/L，呈现严重的白细胞减少是该病的特点。在第二次发热起始时白细胞减至最低水平，并可见中性粒细胞内中毒颗粒及异型淋巴细胞，分类计数通常显示相对的淋巴细胞增多，尚可出现未成熟的中性粒细胞。白细胞计数低下可持续至临床症状恢复后7天。可有血小板减少。
2、生化检查：如果合并肝炎，可见肝生化异常。
3、脑脊液检查：科罗拉多蜱热合并脑膜脑炎患者会出现轻度到中度的脑脊液细胞增多，蛋白质轻度增高。
4、骨髓检查：骨髓检查为有创性检查，通过局部麻醉下骨髓穿刺获得骨髓液进行检查，可见中性粒细胞系统成熟障碍。
5、电镜观察：经负染电镜观察，毒粒形态为圆形，直径约为(87.00±0.05)nm，病毒颗粒的外层可见表面突起。
6、血清学检查：用于科罗拉多病毒诊断的血清学试验，包括血凝抑制试验、酶联免疫吸附测定、补体结合试验、间接免疫荧光试验和中和抗体法等，对急性期和恢复期双份血清进行测定，对科罗拉多病毒的诊断和流行病学调查均有价值。直接免疫荧光染色试验可在红细胞内检出病毒抗原，有助于早期诊断。用酶联免疫吸附测定在感染急性期患者血清中检测针对合成病毒肽的特异性IgM抗体有助于早期诊断。
7、病毒分离及病毒抗原检査：急性期血液或脑脊液或洗涤红细胞接种小鼠或地鼠肾C6/36细胞可分离出病毒，取病人红细胞作免疫荧光染色可检测到病毒抗原。
8、病毒核酸的检测：可检测出患者是否存在病毒，从而确诊本病。