肾动脉彩超在临床上主要用于一些不明原因的高血压患者，尤其是年轻的高血压患者，肾脏不对称也可以进行肾动脉彩超检查。
检查的临床意义是通过彩色超声发现肾动脉有无狭窄，以及狭窄程度、狭窄部位，同时可以观察肾动脉的血流情况和肾脏大小，判断是否是由于肾动脉病变导致的血压增高。
对于反复的血尿患者，尤其是严重的肉眼血尿患者，可以进行肾动脉超声发现是否存在肾动静脉瘘导致的高血压、出血、血尿情况，便于进行对症处理。