人生食或半生食有感染期幼虫的海鲜产品后，异尖线虫蚴寄生在人体胃和小肠肠壁，虫蚴穿过消化道、胃、肠壁进入腹腔，移行其他内脏器官、组织，导致各脏器受到严重感染、损害，而表现不同的临床症状。
一、典型症状
1、胃异尖线虫病：本病急性型多发生在食人生鱼2~8小时后，出现剧烈上腹部疼痛，胃灼热、胃胀，并伴有恶心、呕吐，甚至出现呕血，常被误诊为胆石症、胃溃疡或胃穿孔等症，缓和型多数症状轻微或无症状。本病末梢血象多数呈白细胞中等增加，但嗜酸性粒细胞增加不显著，只有30%左右的病例可见轻度上升。
2、肠异尖线虫病：本病急性型，多在食人生鱼数小时或数十小时后发作，表现为下腹或全腹疼痛、恶心、呕吐、腹胀以及大便不正常等。因此，常被误诊为阑尾炎、肠梗阻或肠穿孔等症，缓和型症状轻微或无自觉症状，本病血象变化和胃异尖线虫病相同。
3、腹绞痛：腹绞痛是指异尖线虫蚴寄生在人体肠道，造成相应部位梗塞、缺血、肠管痉挛而引起上腹或中腹部反复、发作性急性疼痛。可伴有恶心、呕吐、腹泻，常因畏疼痛而减少进食，造成体重减轻。
4、胃肠或肠外嗜酸性肉芽肿：胃肠或肠外嗜酸性肉芽肿是指由生物病原体异尖线虫蚴感染引起的肉芽肿，能形成具有特殊结构的细胞结节，实质是一种炎症反应。
二、其他症状
部分患者可长期无症状，当异尖线虫蚴移行至肝、肾、胰、肺、卵巢、肠系膜等处，导致各脏器严重的蜂窝织炎、嗜酸性脓肿及肉芽肿，称为异位异尖线虫病，咽喉及口腔黏膜也可波及影响。