反流性咽喉炎需要与胃食管反流病鉴别。反流性咽喉炎常以发音困难、声嘶、清嗓、咽异物感、长期咳嗽、喉部分泌物多、吞咽不畅感等为主要症状，纤维喉镜有相应的杓区及声带的特异表现，和上食管括约肌功能不良有关。而胃食管反流常发生于夜间平卧时，以反酸、烧心、胸痛、吞咽困难等为主要症状，胃镜可见食管炎、胃食管疝、Barrett食管等相应表现，主要与下食管括约肌功能异常有关。