慢性肾病目前医学无特效药物治疗，主要是延缓肾功能进展、避免应用肾毒性药物、保护残余的肾功能、控制血压、减少蛋白尿。蛋白尿大于g/24h，血压控制在125/75mmHg，蛋白尿小于1g/24h，血压控制在130/80mmHg，并选用保护肾功能、减少蛋白尿降压药，如血管紧张素转化酶抑制剂和血管紧张素受体阻滞剂，注意其副作用，如干咳、高钾血症、肾功能下降。若出现干咳，不能耐受需停用，若出现高钾血症危及生命，立即停用并降钾治疗，若肌酐两个月内升高大于30%需停用。
慢性肾病呈慢性进行性进展，直至肾衰竭的终末期，即尿毒症期。一旦出现尿毒症的症状，恶心、呕吐、食欲减退、消化道出血，以及胸闷、心慌、气促等心衰的表现，出现尿毒症脑病的精神错乱表现，这个时候就要进行肾脏替代治疗，如血液透析或腹膜透析治疗，积极治疗尿毒症的各种并发症。