临床上对于生殖器溃疡的诊断标准，主要具有以下几点：
1、根据患生殖器溃疡的典型表现，生殖器红肿、皮损等症状进行初步确诊。
2、医生会取患者的可疑皮损组织，在暗视野显微镜下检查，查找是否有梅毒螺旋体，结合梅毒血清学试验为梅毒的确诊依据。
3、医生首先会取样做直接涂片镜检，如发现具有特征性病变的细胞，可对生殖器疱疹做出初步诊断，结合病理检查等各项辅助检查结果，通常不难诊断。