颅内静脉窦血栓临床表现形式比较多样，和血栓发生的部位、范围、病因、年龄都有关系。最常见的症状则包括高颅压症状、卒中样症状以及脑病样症状。
高颅压症状最为常见，患者有明显头痛，可以是发作性或持续性，伴有进行性加重，有恶心、呕吐，且呕吐多为喷射性，眼底检查可以发现视乳头水肿。
卒中样症状包括脑出血或脑梗死的表现，多发性的小出血更为多见，脑病样症状最为少见，一旦出现患者病情都较重，预后不良，主要表现为症状性癫痫、精神障碍、意识障碍、昏迷等。