男性不育的治疗主要包括药物治疗、手术治疗以及辅助生殖技术。
药物治疗应用最为广泛，对于有生殖道感染的可以口服抗生素。对于性腺功能低下的需要补充促性腺激素，口服左卡尼汀口服液、维生素E、辅酶Q10、他莫昔芬、来曲唑等，还可以通过辨证论治采用中医药调理。
手术治疗主要针对精索静脉曲张、梗阻性无精症等。
辅助生殖技术包括人工授精和试管婴儿，主要针对男女双方有严重的生育缺陷，无法通过正常受孕的人群。