肝脓肿的治疗费用还需要根据肝脓肿的严重程度来决定。直径较小、临床症状较轻的肝脓肿，有时通过选用敏感的抗菌药物应用即可控制症状，总体花费可能只需要数千元。对于数目较多、直径较大、出现高热寒战、腹痛、黄疸的肝脓肿患者，不仅需要选用昂贵的碳青霉烯类抗菌药物应用，甚至还有可能需要穿刺引流或者脓肿切开进行治疗。因此总体的花费会明显的升高，有可能达到1万元以上。