甲状腺太小既有先天的因素，也有某些疾病的影响。甲状腺是个工厂利用碘作为原料合成甲状腺激素，调节人体的新陈代谢，促进大脑、骨骼的成熟、发育。甲状腺工厂大小有个体差异，有些人先天的由于甲状腺发育的情况，出现甲状腺明显的变小，但如果测定甲状腺激素水平正常，则不用担心，因为甲状腺功能正常。
有些是由于甲状腺的严重破坏，比如自身免疫性甲状腺炎或萎缩性的甲状腺炎，都可能造成甲状腺组织被破坏，造成甲状腺形态变小。如果甲状腺明显的太小，要测定甲状腺激素水平，如果甲状腺激素水平明显的偏低，要使用左甲状腺激素替代治疗，同样能保证身体正常的代谢。有些人甲状腺太小是由于甲状腺做了手术，或者是甲亢进行了碘-131治疗，都有可能造成甲状腺体积明显的缩小。