高血压的患者慢跑是否会影响到大脑神经系统，需要根据高血压的患者血压是否控制达标判定。如果通过积极的药物治疗，高血压的患者在平时的情况下血压能够控制的非常理想，这样的情况是可以进行慢跑这项体育运动，不会对大脑产生明显的影响。
如果高血压的患者血压没有得到有效的控制和达标，去进行剧烈的体育活动，就可能造成运动过程中的血压水平剧烈、明显的升高，严重的情况下可能会发生脑出血的风险，因此高血压的患者能否进行慢跑，需要在血压控制达标的前提下，再进行这样的运动。