肛周脓肿如果初期症状比较轻，可以进行保守治疗。在饮食方面要注意吃清淡的食物，避免辛辣、刺激、燥热的食物，并且不能喝酒。可以口服抗生素，选择头孢类或者喹诺酮类广谱抗生素，再加上甲硝唑或者替硝唑，选择针对厌氧菌感染的抗生素口服。必要的时候可以给予静脉输注抗感染的药物，可以选头孢类的药物，也是联合甲硝唑或者替硝唑，针对肛周脓肿最常见的致病菌都有作用。
还可以给予温水或者是配合中药坐浴，一方面可以促进肛门周围的血液循环，促进炎症的吸收，另一方面也可以改善局部的疼痛症状。要注意个人的清洁卫生，保持局部干燥，注意肛门局部的卫生。经过保守治疗，1-2天以后如果症状明显缓解、疼痛减轻，肿块也不再扩大或者有缩小，可以继续采用保守治疗的方法。但是如果症状加重，体温升高开始发烧，或者疼痛加剧、肿块变大以后，就要果断去医院找医生就诊，必要的时候要采用手术治疗的方法，千万不能耽误病情。