没有临床症状的膈下食管憩室可以定期观察，暂时无需处理。直径较小、临床症状较轻或者年龄较大、不能耐受手术的膈下食管憩室，可以选用内科保守治疗，可以考虑选用质子泵抑制剂、胃黏膜保护剂、制酸剂以及促动力药物，可以联合也可以单独应用，同时还要注意饮食规律，避免暴饮暴食，避免进食刺激性食物。而内科保守治疗效果欠佳，反复发作，还应当及时考虑手术，包括内镜下或腹腔镜手术治疗。