由于肝内胆管结石大多数是含有细菌的棕色胆色素结石，因此熊去氧胆酸对于肝内胆管结石效果欠佳，不推荐口服使用。对于没有症状、直径较小的肝内胆管结石，是无需口服药物治疗，如果合并轻度胆管炎，也可以考虑口服消炎利胆片、舒胆片、胆宁片、熊胆胶囊等。而对于出现明显高热、寒战、腹痛、黄疸的急性胆管炎，这是口服药物是无法控制症状的，还需要通过静脉输液治疗控制感染，另外，最重要的是根据肝内胆管结石的直径、部位、是否出现胆管狭窄以及局限性肝萎缩，选择单纯取石或者局部肝切除等手术治疗，以达到根治的目的。