肝内胆管结石如何治疗要根据情况决定。如果说仅仅是少量肝内胆管结石、并没有明显的胆管扩张梗阻，也没有肝脏形态学的改变（比如萎缩），也没有胆管癌变等情况，这种情况通常不需要特殊治疗。因为手术的治疗并不能够完全取尽所有的结石，其创伤反倒很大，多数这种情况予以平时生活，不要过于劳累，不要受凉感冒，少吃油腻食物予以调理。而如果结石分布比较多比较广，明显的胆管扩张，胆道畸形，局部狭窄或者是经常发生胆管炎，或者甚至已经癌变，这种情况应该积极手术治疗，尽量取尽结石，切除已经病变的肝脏，解除胆道梗阻，充分引流胆汁。