寻常疣长到了脚底，就称之为跖疣。由于足底经常受到压迫，所以跖疣不向外生长，而容易向皮肤下部生长，造成剧烈疼痛，并且给治疗也带来困难。临床上最常用的治疗是冷冻，但是跖冷冻治疗必须要多次才能够完全治愈。
除了冷冻以外，还可以选择局部外用腐蚀性药膏或者抗病毒外用药。对于顽固的跖疣还有更为积极的方法，比如局部注射博来霉素、外科手术切除、光动力方法。对于非常多的跖疣，也可以考虑口服泰尔丝来治疗。