肾囊肿与脑梗死，肯定是先治疗脑梗死。因为脑梗死常常在高血压的患者中出现，由于血压的增高，血液黏滞度增加，导致血管的硬化，尤其是糖尿病的患者，非常容易发生脑梗死。
脑梗死发生后，由于梗死的部位及面积不同，临床表现有一定差异，但属于临床急症，需要积极的治疗，防止梗死面积的进一步扩大，同时促进肢体的活动，明显达到改善、恢复肢体功能的目的。而肾囊肿是一种良性病变，通常情况下，即使是巨大的肾囊肿，也不会突然发生危及生命的并发症。