脑部发育不良的症状，可表现为运动障碍、智能发育障碍和癫痫发作等。脑部发育不良患者，临床症状多数开始于婴幼儿期，特点可表现为运动障碍，主要为锥体系损伤，同时可并发小脑、脑干和脊髓等损伤。
患者常伴有智能发育障碍和癫痫发作，病情轻重不一，部分患者可有视力障碍，如斜视、弱视、视野缺损、听力障碍以及认知和行为异常症。患者可出现不同程度的肌张力增高、腱反射亢进、肢体瘫痪及病理征阳性。