乳腺癌基因检测的目的，是可以预测乳腺癌预后、复发、瘤灶转移，乃至为指导治疗提供信息，为患者的个体化治疗提供帮助。
乳腺癌基因检测是临床最常用的预测乳腺癌预后的指标之一，包括16种肿瘤相关基因、五种参考基因。特定的算法是将基因表达量转化为复发评分，小于18分为复发低危，18-30分为复发中危，大于31分为复发高危。复发高危和复发低危，对临床决策有清晰的指导意义，患者的复发指数越低，复发的几率也就越低，同时预测患者越不容易在化疗中获益。因此医生可以建议复发低危者只使用内分泌治疗，可以免除化疗，病人的痛苦很小，对以后的影响不大。复发高危者从化疗中获益较大，需要进行内分泌治疗和化疗。