自身免疫性脑炎一般来说都是侵犯边缘系统，有着边缘系统受损的表现，比如侵犯颞叶、海马、杏仁核部位，导致注意力不集中、记忆力急剧下降、反应迟钝。另外由于脑叶的受损、皮层的受损，患者可以出现精神症状，出现幻觉，可以出现妄想、癫痫发作。
自身免疫性脑炎又由于是炎症性的表现，患者也可以出现发烧现象。如果人突然间出现记忆力的急剧损伤、认知功能下降、精神症状、烦躁、不合作，或者出现发烧、癫痫发作情况，都需要考虑有没有自身免疫性脑炎的可能。