球孢子菌病的病因主要为吸入球孢子菌菌丝而引起发病。疾病的过程多变，因宿主免疫力及感染病原菌数不同而变化。本病的传播途径为呼吸道吸入球孢子菌及接触了球孢子菌。好发于到过流行区、免疫低下的群体。
一、主要病因
1、球孢子菌感染：本病多数患者由球孢子菌菌丝被吸入呼吸道而发病。
2、免疫力低下：机体发病的关键因素除了球孢子菌感染还有免疫力低下，免疫低下时机体发生感染后更易发病。早期引起中性粒细胞为主的急性炎症反应，在孢子发育和形成内生孢子的过程中，组织反应逐渐由急性化脓性炎症过渡到慢性肉芽肿，由于临床表现出现较晚，有时要到流行区外才出现明显的感染症状。
二、诱发因素
长期服用免疫抑制类药物或有自身免疫病者可有免疫低下，在有球孢子菌感染后诱发该病。