美牙仪的主要的副作用是对牙齿和牙龈的损伤。因为美牙仪大多数是由于冷光美白牙齿，利用高浓度的氧化锌对牙齿的主体产生化学反应起到美白的效果，但是化学物质可能会对牙龈及牙齿表面进行损伤产生酸胀疼痛的感觉，这种情况叫做牙齿过敏的现象，同时会引发增加牙齿碎裂的机会。因此不建议过度频繁的使用美牙仪，使用期间要注意保持口腔清洁卫生，定期口腔科牙齿及牙龈健康检查。