曲霉病患者的主要症状与感染部位有关，最常见的症状是发热、咳嗽、绿色脓痰、喘息等。病情较重也可引起咯血、胸痛、皮肤红斑、头痛、昏迷等全身感染症状。常见的并发症包括支气管扩张、败血症等，不及时治疗可能引起死亡。
一、典型症状
曲霉菌侵犯不同部位引起的症状不同。
1、肺曲霉病：患者主要可出现干咳、胸痛等症状，部分患者有咯血，呼吸困难。
2、皮肤黏膜曲霉病：患者可有皮肤丘疹、红斑、脓肿、溃疡等皮损表现。
3、泌尿系统曲霉病：患者可出现膀胱刺激征如尿频、尿急、尿痛，部分患者可伴有血尿、发热等症状。
4、消化系统曲霉病：患者可出现腹痛、腹胀、发热、食欲减退、柏油样大便等。
5、脑曲霉病：患者可出现发热、头痛、呕吐等症状。
6、眼、耳、鼻曲霉病：患者具体可表现为怕光、流泪、眼痛，严重者失明；耳鸣、听力下降；鼻塞、局部酸痛等。
二、其他症状
消化系统曲霉病：1、累及肝脏可出现右上腹疼痛、饱胀不适等症状，还可伴发热、食欲减退。
2、累及胃肠道可出现腹胀、腹痛等症状，还可出现柏油样大便或血便等。