反复发作的口腔溃疡也被称为复发性阿弗他溃疡，其病因十分复杂，导致口腔溃疡反复发作的病因也是多方面的，首先有明确的遗传因素，如果父母有反复发作的口腔溃疡，孩子发生类似情况的可能性大大增加。其次，口腔溃疡的复发有营养方面的病因，如果长期偏食，饮食中缺乏维生素，尤其是维生素B；缺乏微量元素，尤其是硒、锌等微量元素，发生口腔溃疡反复发作的可能性较高。再者，口腔卫生不良和其它一些不良习惯，如长期吸烟、饮酒等，也是导致口腔溃疡反复发作影响因素。研究显示精神心理因素也会导致口腔溃疡反复的原因之一，长期抑郁、焦虑的患者更容易导致口腔溃疡复发。最后，局部刺激因素也对口腔溃疡的反复发生有一定的作用，如果口腔中有残根、残冠和不良修复体，受到反复刺激也会导致口腔溃疡反复发作，不愈合。