大多的彩超可以判断低位肛瘘以及高位肛瘘。特别是直肠腔内超声，在检查时可以比较清楚的看到瘘管与肛管支撑环的关系，检查时如果瘘管是位于肛管直肠环下方的为低位肛瘘，而如果瘘管跨过肛管直肠环为高位肛瘘，检查和彩超医生的临床经验以及技术水平也有一定的关系。术前对瘘管做出高位或者低位的评估，对手术非常有指导价值，可以减少术中不必要的损伤以及提高手术的治愈率，降低术后复发率。