引起肾盂肾炎最常见的致病菌为革兰性阴性杆菌，其中以大肠杆菌最为常见，多数为上行感染。一般情况下革兰性阴性杆菌多寄居在泌尿，当身体健康的时候机体抵抗力强，细菌在尿道中出现的时候会被尿液冲洗，很难发生感染。但是免疫力降低时，饮水少，尿量少，细菌在局部繁殖后逆行经过膀胱、输尿管，侵入肾盂，可引起肾盂肾炎。治疗上以喹诺酮类，二、三代头孢菌素等药物相对较敏感。