马拉色菌病的治疗是局部使用抗真菌药物，对于面积较大或反复发作的患者，可给予酮康唑、氟康唑等唑类药物口服治疗。
一、药物治疗
1、玫瑰癣：
（1）局部治疗：皮损面积较局限者以外用疗法为主。外用抗真菌制剂。可用复方雷琐辛酊、水氯酊、2%酮康唑洗剂、咪康唑霜、1%联苯苄唑酊或霜剂、1%特比萘芬霜或凝胶外洗或涂搽。
（2）全身治疗：皮损广泛而顽固者可考虑内服系统抗真菌药。可选用氟胞嘧啶、酮康唑片、伊曲康唑和氟康唑。
2、糠秕孢子菌毛囊炎：
（1）2%酮康唑香波：每天洗澡1次，在患部擦至发泡后，停留5分钟，清水冲干净与其它药联合应用可有协同作用。
（2）联苯苄唑酊或霜：外用，本品含渗透剂氮酮，渗透性高，疗效好。
（3）酮康唑：饭后服用，本品可损害肝功能，久服要定期检查肝功能。
（4）伊曲康唑：饭后服，每月服1周，间歇冲击2个月。本品有良好的“药物后效应”，故每月服1周，停药3周仍有治疗效果。副作用少，但价格较贵，且停药后有复发。
（5）免疫调剂剂：本病容易复发，在治疗时，除进行抗真菌治疗外，需同时使用调节免疫的药物，比如大剂量口服胸腺肽等。还需要减少皮肤油脂分泌，可口服些抗雄激素类药物，比如螺内酯、西咪替丁(男性须在医生指导下进行，因为此两种药极少数情况下会引起暂时性的阳痿)，女性也可以选择炔雌醇环丙孕酮片，也可选择阻碍皮脂腺生成的药物，如维胺酯和异维A酸软胶囊。
二、手术治疗
暂无针对性手术方法进行治疗本病。