1、口腔视诊：主要是观察患者牙面的色泽变化，有无凹陷、缺损，是否有多牙患病，患牙表面斑块覆盖情况并以此判断疾病进展。
2、实验室检查：主要检测血浆中氟的含量，以及钙、磷等代谢物的浓度，主要适用于中重度氟牙症患者，判断其是否伴发氟骨症样骨质改变。
3、影像学检查：主要行口腔X光片检查或CT检查腰腿关节、骨膜、韧带有无钙化情况，判断患者是否有合并氟骨症以及关节病变。