脑血栓在急性期发病4.5小时之内，可应用静脉溶栓，在发病6小时之内，可以应用动脉溶栓治疗，如果超过了12小时，就错过了宝贵的溶栓时间窗。这时最主要的治疗就是给予抗血小板聚集药物，如口服阿司匹林，如果患者对阿司匹林过敏或者不能耐受，可用氯吡格雷替代。患者还要注意控制过高的血糖，将血糖控制在10毫摩尔/升左右水平，还需控制过高的血压。对于大面积的脑血栓、脑干血栓、小脑血栓的患者，可以应用甘露醇降低脑水肿。有呼吸道或泌尿系感染者、发热者，可给予抗生素治疗。如果大面积脑血栓伴有严重的脑水肿，为了避免出现脑疝，可以给予去骨瓣减压术。当病情稳定后，早期进行康复治疗。