颅内静脉窦血栓可以导致严重的脑水肿、颅内高压和继发性脑出血，在尽快确诊的前提下给予有效的治疗。首先给予药物治疗，应当积极控制癫痫发作、降低颅内压、止痛以及抗炎治疗，并给予系统的抗凝治疗，能够有效的降低致残率和死亡率，抗凝治疗是静脉窦血栓的主要治疗措施，可给予肝素、低分子肝素或华法林治疗。其次，如果严格的内科药物治疗无效，并出现颅内压增高的症状逐渐加重，腰椎穿刺脑压在250毫米水柱以上，可以考虑给予血管内机械碎栓治疗或者静脉窦局部接触溶栓治疗等。