肠道厌氧菌感染可分为内源性感染和外源性感染，外源性感染多由进食厌氧菌感染的食物或接触带有厌氧菌人群所致，内源性感染多因肠道菌群失调所致。本病好发于免疫力低下人群，不洁饮食或使用抗菌药物治疗时可诱发。
一、主要病因
1、内源性感染：肠道厌氧菌的内源性感染多由肠道菌群失调所致，如患者接受抗菌药物治疗，诱发原本存在于肠道中的梭状芽孢杆菌异常增生。
2、外源性感染：肠道厌氧菌的外源性感染可因进食被厌氧菌污染的食物、饮水，或接触厌氧菌的携带人群或动物，经口传播所致。
二、诱发因素
1、有不洁饮食史，或与厌氧菌的携带人群或动物发生密切接触。
2、使用抗菌药物治疗时，其副作用可诱发本病。