腹膜间皮瘤采取个体化治疗原则，医生会根据患者的年龄、体质、肿瘤分期，选择最合适的治疗方法，一般有手术、放疗、化疗及几种治疗手段联合等方式，现多采用综合治疗。
一、药物治疗
患者通常无一般药物治疗。
二、手术治疗
1、腹腔减瘤术：按照肿瘤分布的位置，尽可能去除可见的肿瘤，最多需要六种腹膜剥离手术，使得所有腹内表面肿瘤得到切除或剥离。Ⅰ期和Ⅱ期患者应优先考虑此手术，局限性老年腹膜间皮瘤无论良恶性均应首选手术切除。
2、细胞减灭术联合腹腔热灌注化疗：细胞减灭术指全腹膜切除术，适合年龄小于75岁、无明显手术禁忌证、无肝脏或远处转移、术前评估预计能行完整的细胞减灭术的恶性腹膜间皮瘤患者。完成细胞减灭术后再进行腹腔热灌注化疗，通过灌注导管将化疗药液加热后灌注进入腹腔。细胞减灭术联合腹腔热灌注化疗，能延长恶性腹膜间皮瘤患者生存时间，提高生存率，满足条件的患者应该进行该手术治疗。
3、术后腹腔灌注化疗：分为术后早期腹腔灌注化疗和术后长期常温灌注化疗，适用于无腹外转移或肝实质转移的恶性腹膜间皮瘤患者，可杀灭术后残余的微小瘤灶，且腹腔局部用药可增加腹膜肿瘤部位的化疗药物浓度，减少化疗药物的全身副作用，能够延长恶性腹膜间皮瘤患者的生存时间。
三、放射治疗
一般不单独使用，多配合其他治疗方案综合治疗，多用于晚期腹膜间皮瘤患者。放疗适用于手术切除不彻底或无法切除的病例，依病变范围决定全腹照射或局部照射，可帮助减少晚期癌症的症状和体征。
四、化学药物治疗
1、培美曲塞：通过破坏细胞内叶酸依赖性的正常代谢过程，抑制细胞复制，从而抑制肿瘤的生长。与顺铂联合应用具有协同抗癌作用，培美曲塞联合顺铂是腹膜间皮瘤的一线化疗方案。哺乳期妇女和儿童慎用，有严重培美曲塞过敏史的患者和孕妇禁用。
2、顺铂：具有细胞毒性，通过抑制肿瘤细胞DNA复制发挥抗癌作用，多与培美曲塞联用治疗腹膜间皮瘤。
3、5-氟尿嘧啶：广谱抗癌药，通过抑制DNA和RNA的合成抑制肿瘤细胞增殖，使用者若发生严重的胃肠道反应如血性腹泻或便血应立即停止用药。此外，该药能抑制骨髓使血小板下降、白细胞减少，故用药期间应严查血象。
4、丝裂霉素：抗生素类化疗药，可使DNA解聚并拮抗DNA的复制，在酸性和缺氧条件下也能发挥抗肿瘤作用。该药对骨髓有抑制作用，因此用药期间应严查血象。此外，水痘或带状疱疹患者、孕妇及哺乳期妇女禁用。
5、紫杉醇：通过作用于微管蛋白抑制肿瘤细胞增殖发挥抗癌作用，辅助治疗腹膜间皮瘤。对聚氧乙烯蓖麻油过敏者、白细胞过低严重骨髓抑制者、孕妇和哺乳期妇女禁用。
6、长春瑞滨：广谱抗癌药，毒性低，通过干扰细胞有丝分裂期微管的聚集而产生细胞毒作用。该药能使粒细胞减少，应严查血象，出现异常应立即停止用药至血象恢复正常。妊娠期、哺乳期妇女和严重肝功能不全者禁用，肾功能不全者应慎用。
五、其他治疗
免疫疗法、分子靶向疗法、基因治疗等也有研究应用，具有较好的应用前景，但目前相关研究尚不完整，相关技术尚不成熟而无法普及。