对于会厌囊肿的治疗主要是采取手术的治疗方式。但是并不是所有出现会厌囊肿的患者都需要手术治疗，要根据会厌囊肿的大小以及患者的主观感觉来决定。如果患者会厌囊肿相对较小，患者也没有咽喉部明显的不适症状，就可以先随诊观察，不急于手术。如果患者会厌囊肿体积较大，进一步导致了咽喉部的堵塞感、异物感等症状，就需要酌情考虑进一步的手术治疗。