如果是脑梗死急性期，治疗包括密切监测生命体征，必要时吸氧、防治并发症，如防治脑水肿、感染、上消化道出血和深静脉栓塞等。特殊治疗包括超早期溶栓、取栓、抗血小板、抗凝和脑保护剂的应用等，必要时可考虑手术治疗。
恢复期应根据不同病因和病情选择不同的治疗方法，长期服用阿司匹林或氯吡格雷进行二级预防。控制危险因素，如高血压、糖尿病、高脂血症和高同型半胱氨酸血症等治疗标准的控制。
合并房颤者应积极治疗房颤和抗凝治疗，也可按疗程服用胞磷胆碱、吡拉西坦和丁苯酞等促进脑功能恢复的药物。如果符合适应证，可考虑血管内介入治疗等。