生殖器疱疹的危害是非常大。生殖器疱疹，可以引起播散性疱疹，脑膜炎，前列腺炎，直肠炎，盆腔炎，脊髓神经根疾病等一系列的并发症。生殖器疱疹常与其他性传播疾病，比如淋病，非淋菌性尿道炎，梅毒尖锐湿疣，等混合感染。生殖器疱疹还可以导致人工流产后不孕症以及男性不育症。孕妇生殖器疱疹可引起子宫内的感染和新生儿的感染。