单纯性甲状腺肿的治疗包括药物治疗和手术治疗。
一、药物治疗：
常用药物：左旋甲状腺素片
单纯性甲状腺肿可以通过服用左旋甲状腺素片治疗，主要作用是抑制垂体分泌促甲状腺激素，有助于肿大甲状腺的恢复。药量应以不降低血促甲状腺激素浓度、不发生甲状腺毒症，而肿大的甲状腺缩小为宜。这适用于缺碘、高碘及其它原因引起的单纯性甲状腺肿。
二、手术治疗
有下列情况者适于手术治疗：
（1）甲状腺显著肿大引起压迫症状或有碍工作生活者, 经内科治疗无效。
（2）结节性甲状腺肿疑有癌变, 尤其是单个结节发生于年轻患者, 宜早手术。
（3）结节性甲状腺肿发生甲亢者。
儿童和青春期生理性甲状腺肿者，禁忌手术治疗。