食管炎的药物治疗主要是通过促进胃动力的药物，如多潘立酮，莫沙比利依托比利，这类药物可以通过增加，食管下括约肌的压力，改善食管的蠕动功能，促进胃排空，从而达到减少胃内容物食管反流以及减少，使管道暴露时间，还可以用h2受体拮抗剂，如西米替丁雷尼替丁法莫替丁。它能够有效的抑制胃酸的分泌，质子泵抑制剂，包括奥美拉唑，蓝索拉唑，泮托拉唑。抗酸的药物主要是氢氧化铝，中和胃酸。