麻醉一般对胃镜病人没有什么危害。但是存在一定潜在的并发症，这些并发症的发生可能会对病人造成一定的危害。因为胃镜的麻醉一般是采用全身麻醉，全身麻醉后患者呼吸会受到抑制，呼吸会变浅变慢，有些病人还会出现呼吸道梗阻的情况，如果不及时处理病人会出现窒息缺氧。由于胃肠镜麻醉是浅的全身麻醉，在插入胃镜的过程中少数会出现喉部痉挛的情况，也容易导致病人出现窒息缺氧。