心房心肌梗死的患者常常会出现心律失常、栓塞、心房破裂等一系列的临床症状，如治疗不及时可能会出现心包填塞的并发症。
1、心律失常：是心房梗死最常见的临床表现，具有突发突止的特点，包含阵发性心房纤颤、房性心动过速、房性期前收缩、心房游走性节律等。
2、栓塞：表现为心房附壁血栓形成以及栓塞的形成，是心房梗死的常见症状之一，心房梗死时84 %可有附壁血栓，由于心房梗死多发生在右房，肺动脉栓塞较体循环栓塞更常见，约24%心房梗死患者发生肺动脉栓塞，亦有左房栓子引起体循环栓塞的报道。
3、心房破裂：已确诊为心房心肌梗死的患者，有4.5%的患者会发生心房破裂。
4、血流动力学改变：心房收缩有效地增加心输出量，在病态心脏尤为重要，心房梗死时，心房缺血坏死所引起的心房收缩力降低可引起明显的血流动力学异常，心房颤动和室上性心动过速时心输出量降低，而房室顺序起搏时可增加心输出量，说明心房收缩比较重要。因此心房梗死时，更难以维持心室充盈压，从而使心输出量降低，其血流动力学改变与右室心肌梗死相似。