单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，一般不需治疗。只要半年到1年随诊。如果囊肿直径较大超过5cm，或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术，并囊内注射硬化剂，或者行手术治疗。多囊性肾脏病(简称多囊肾)是基因突变导致的遗传性疾，并目前尚无有效的干预措施。近年来一些旨在抑制囊肿生长的药物，如血管加压素2受体拮抗剂、生长抑素，西罗莫司等正在进行临床实验，疗效和不良反应尚未明确。目前治疗的重点在于治疗并发症，缓解症状，保护肾功能。