腓总神经卡压症主要采取保守治疗，通过药物、支具等方法解除对腓总神经的压迫；当解除压迫后神经功能恢复不良或患者症状严重者，可采用手术治疗。
一、药物治疗
1、非甾体抗炎药：如双氯芬酸、布洛芬等，主要由于缓解患者小腿的疼痛和肿胀，必要时在医生指导下服用。
2、营养神经药物：当腓总神经受损后，可口服甲钴胺，促进神经内核酸、蛋白、脂肪代谢，有利于神经组织修复，改善神经组织传递及代谢障碍。也可配合维生素B1、维生素B6等，以促进神经功能恢复。
二、手术治疗
1、腓总神经松解术：是腓总神经卡压症的经典手术方式，其疗效的优良很大程度上起决于神经卡压时间的长短，卡压时间越长疗效越差，卡压时间越短疗效越好。适用于保守治疗效果不佳或神经受伤严重的患者，可及时的解除压迫，促进神经功能的恢复。
2、神经移植或肌腱移位术：对于发病2年以上或神经松解无效者等主张显微外科操作下使用神经移植和肌腱移位以平衡足的运动功能。神经移植和肌腱移位是对神经、肌腱不可逆损害的一种替代修复，重建腓总神经的功能，使患者在一定程度上达到正常行走的状态。显微操作下神经移植的优点是切口小，操作精细，损伤小，对正常组织损伤小。
三、其他治疗
1、支具治疗：可佩戴矫正鞋，将踝关节固定，避免脚踝受伤；
2、封闭针：局部封闭，解除神经压迫。