先天性青光眼中婴幼儿型青光眼的典型症状是畏光、流泪和眼睑痉挛。青少年型青光眼一般不会引起畏光流泪、角膜增大等症状，早期主要表现为进行性近视度数加深和视力减退。还可伴有其他先天性的全身发育异常，如前房角发育不全，无虹膜性青光眼，伴有颜面部血管病和脉络膜血管瘤的青光眼等。
一、典型症状
1、婴幼儿型青光眼：
（1）畏光流泪及眼睑痉挛：患者早期出现黑眼珠大且发灰，不能阻止多余光线进入，则表现为畏光。眼压升高会造成角膜水肿，从而出现流泪及眼睑痉挛的表现。
（2）角膜浑浊：由于房水不能有效循环，代谢产物不能完全排出，日久会有蛋白质等物质沉积在晶状体内，造成角膜混浊的表现。
（3）角膜扩张：眼压升高会造成角膜水肿，而角膜水肿后又会加重眼内的压力，从而形成恶性循环，出现眼球增大、角膜扩张的表现。
（4）角膜后弹力层破裂：角膜扩张到一定程度后，角膜后弹力层由于压力过大，会发生水平弯曲，如果不及时降低眼压，甚至会导致角膜后弹力层破裂。
（5）视乳头凹陷扩大：随着病情的发展，眼压不断升高，视乳头凹陷也会随之进一步扩大，严重影响视力。
2、青少年型青光眼：
（1）进行性近视度数加深：青少年型青光眼病情较严重，眼压迅速增加，可导致近视度数进行性加深和视力减退。
（2）视神经萎缩合并视野缺损：病情进一步发展，眼压持续增高，会出现进行性视神经萎缩及视乳头凹陷扩大，同时合并有视野缺损。
3、先天性异常的青光眼：
（1）马方综合征：又称蜘蛛指综合征，是一种常染色体显性遗传结缔组织病，眼部表现为继发性青光眼、白内障、斜视、虹膜震颤、视网膜剥离等。
（2）短指-晶状体脱位综合征：是一种少见的伴有全身发育异常的遗传性疾病，继发青光眼的发生率很高，眼部表现主要是小球形晶体、晶体移位、视网膜脱离等。
（3）Sturge-weber综合征：又称为脑面血管瘤病，是以眼部血管瘤、皮肤血管瘤及脑血管瘤为主要表现的疾病。临床表现为一侧面部三叉神经分布区不规则血管痣、青光眼、对侧偏瘫、同侧颅内钙化、癫痫发作及智力减退等。
二、其他症状
部分患者会出现眼球萎缩，主要表现为眼球体积缩小、虹膜萎缩、屈光介质混浊，导致视功能进一步减退，直到完全失明。