男性甲状腺结节的病因主要有遗传因素，家族性的甲状腺肿，因为有遗传酶的缺乏，影响甲状腺素的合成。另外在怀孕期或者是哺乳期或者是精神受到刺激等情况下，对碘的需求就比较高，这种情况下如果碘摄入不足也会导致这种结节的生成。一些药物也容易导致甲状腺结节，例如硫氢化钾，或者是对氨基水杨酸等。男性经常抽烟或者喝酒，也容易诱发甲状腺结节。