临床上并不存在预防牙源性角化囊肿最有效的方法，由于牙源性角化囊肿发病机制比较复杂，故针对病因进行预防存在一定难度。但可以通过远离或者消除诱发因素，来避免疾病的发生或者加重。具体可采取以下方法进行预防：
1、重视牙齿健康，注意口腔卫生，每年定期复查口腔状况；
2、日常生活中注意饮食健康，尽量避免摄入大量辣椒、洋葱等辛辣刺激性食物，或火锅等过烫的食物。